不光是生信，感觉整个生物领域越来越靠图吃饭了。谁的图漂亮，谁的分析就好。好吧，我也承认，图多图漂亮了，确实显得高大上哈。在我眼中图的信息量比较大，能够给人直观的表示，为了说明图的意义，我没把持住，在本文多放了几张和circos图无关的图，见谅。本文有多图，都是本人自己画的，请勿盗图，如果你想知道怎么做或者由更好的表示办法，欢迎留言讨论。

想当年，我为了表示SNP在染色体上的数目分布，用python画了24个图，每个染色体一张SNP的密度分布。那可是我第一次用matplot。

先上我年yi轻qian时做的图，那个时候我都佩服自己能想出可以用图的形式来表示突变的密度，哈哈哈,因为这样就能很直观的看出哪些地方突变频率比较高，突变频率比较高的地方，可能是突变热点区域，在肿瘤研究中常常有意义。

我合并多个文件，用cat将流重定向到一个文件，或者把一个大文件rm掉腾出空间，要进行IO，但如果这个时候服务器有进程进行IO时，同个进程同时进行IO，效率就会很慢。有时候我想把别的进程IO缓一缓，先把合并或者rm的任务有限解决掉，再继续别的进程的IO。

就google了下如何提高效率，查ionice这个命令。

ionice - 获取或设置程序的IO调度与优先级，通过设置命令或进程的IO调度优先级，加快IO效率

命令格式

跟命令时，设置命令的IO调度优先级，跟PID时，设置相应进程的IPD调度优先级。

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ionice [[-c class] [-n classdata] [-t]] -p PID [PID]...
ionice [-c class] [-n classdata] [-t] COMMAND [ARG]... 

我也进行了测试，比如在有其进程进行IO工作时，我要在删除Fastq文件（R1文件20G，R2文件21G）时，用法详见下文。

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time rm R1.fastq
real    0m37.306s
user    0m0.001s
sys     0m0.300s

time ionice -c 2 -n 0 rm R2.fastq
real    0m2.579s
user    0m0.002s
sys     0m0.682s

可以看到当提高IO的优先级后，效率还是非常快的，当然这暂时牺牲了其他进程的IO。

ionice -h用法

下载文件夹 $ wget -c -r -nd -np -k -L -p -A c,h www.xxx.org/pub/path/

-c 断点续传 -r 递归下载，下载指定网页某一目录下（包括子目录）的所有文件 -nd 递归下载时不创建一层一层的目录，把所有的文件下载到当前目录 -np 递归下载时不搜索上层目录，如wget -c -r www.xxx.org/pub/path/ 没有加参数-np，就会同时下载path的上一级目录pub下的其它文件 -k 将绝对链接转为相对链接，下载整个站点后脱机浏览网页，最好加上这个参数 -L 递归时不进入其它主机，如wget -c -r www.xxx.org/ 如果网站内有一个这样的链接： www.yyy.org，不加参数-L，就会像大火烧山一样，会递归下载www.yyy.org网站 -p 下载网页所需的所有文件，如图片等 -A 指定要下载的文件样式列表，多个样式用逗号分隔