wget命令小结
下载文件夹 $ wget -c -r -nd -np -k -L -p -A c,h www.xxx.org/pub/path/
-c 断点续传 -r 递归下载,下载指定网页某一目录下(包括子目录)的所有文件 -nd 递归下载时不创建一层一层的目录,把所有的文件下载到当前目录 -np 递归下载时不搜索上层目录,如wget -c -r www.xxx.org/pub/path/ 没有加参数-np,就会同时下载path的上一级目录pub下的其它文件 -k 将绝对链接转为相对链接,下载整个站点后脱机浏览网页,最好加上这个参数 -L 递归时不进入其它主机,如wget -c -r www.xxx.org/ 如果网站内有一个这样的链接: www.yyy.org,不加参数-L,就会像大火烧山一样,会递归下载www.yyy.org网站 -p 下载网页所需的所有文件,如图片等 -A 指定要下载的文件样式列表,多个样式用逗号分隔
测序正负链和转录翻译正负链概念
利用wordcloud R包绘制词云
根据词的频率,以词云的形式展示,更加具有表现力。词在’词云’图中字号越大,重要性也就越高。主要涉及数据的挖掘,和数据的展示(可视化)。

下面的代码为利用wordcloud包绘制上面词云图
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测试文件下载:TXT
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1.miRBase: http://www.mirbase.org
miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA 序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。
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动物 miRNA 的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验证的, 预测的 miRNA的靶目标. 靶标预测工具DIANA-microT, MicroInspector, miRanda, MirTarget2, miTarget, NBmiRTar, PicTar, PITA, RNA22, RNAhybrid, and TargetScan/TargertScanS.
3.PMRD: http://bioinformatics.cau.edu.cn/PMRD/
PMRD是一个关于植物MicroRNA 数据库,包括了microRNA序列和它们的靶基因、二级结构、表达谱、基因组搜索等等,并且该数据库尝试着整合大量的关于植物microRNA的数据。
