用SRA-Explorer下载测序数据

下载数据的时候,偶然碰到了SRA-Explorer,感觉挺好用的,地址:https://sra-explorer.info/

这个页面本身非常小,见https://github.com/ewels/sra-explorer,利用的是SRA API。

检索好之后,选择你想下载的样本,点击Add ** to collection,然后点击右上角saved datasets,页面下方就可以原始的fastq的链接,用curl下载fastq的命令,用aspera下载fastq的命令,还有下载SRA的命令,以及样本的metadata。非常好用。

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#Author: Jason
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