Illumina测序平台介绍

A short introdution of Illunima sequencing machine, especially for Hiseq.

Illumina测序平台

 

HiSeq 2000 HiSeq 2500 HiSeq 3000 HiSeq 4000
Output 500-600 GB 900-1000 GB 630-750 GB 1300-1500 GB
Reads passing Filter 1.7-2 billion 3-3.3 billion 2.1-2.5 billion 4.3-5 billion
Read Length 2 x 100bp 2 x 125bp 2 x 150bp 2 x 150bp
Quality Scores(Q30) >85% >80% >75% >75%
Run Time 11 days 6 days 3.5 days 3.5 days
Human Genomes per Run Up to 5 Up to 8 Up to 6 Up to 12
Exomes per Run Up to 72 Up to 120 Up to 90 Up to 180
Transcriptomes per Run Up to 40 Up to 67 Up to 50 Up to 100

hiseq-x-ten Illumina测序平台

Hiseq 2500

Hiseq 2500是Hiseq 2000的升级版。其主要的改进点是:Hiseq 2500可以在快速、高通量两种模式之间切换。高通量模式就是原来的Hiseq2000的每张Flowcell有8个Lane的模式。

Hiseq 2500的快速模式,核心的改进是用2个Lane的Flowcell来测序,而且这种快速Flowcell的Lane比Hiseq 2000的Lane要短,数据产量也略低于高通量模式的2条Lane。

HiSeq 3000

基于成熟的HiSeq 2500系统,凭借创新的图案化流动槽技术,HiSeq 3000/4000系统带来了无可匹敌的速度和性能。双流动槽的HiSeq 4000系统提供了最高的通量和每个样品的最低价格,适合广泛的应用。而单流动槽的HiSeq 3000系统则享有同样的低价格和快速运行时间。

HiSeq 4000

HiSeq 4000系统每次运行3.5天,最多可产出1.5T数据。与HiSeq2500系统(PE125)相比,HiSeq 4000相同时间总产出是HiSeq2500的3倍。HiSeq 4000系统可平行进行单或双流动槽模式,在最短的时间内提供最大化的数据输出。

HiSeq X Ten和NextSeq 500。HiSeq X Ten定位为工厂规模的测序仪,通量超高,价格不菲;而NextSeq 500则旨在以MiSeq的大小提供HiSeq的性能。

NextSeq 500

NextSeq 500系统集高通量测序的性能和台式测序仪的简约为一体,是目前唯一一款可实现外显子组、转录组和全基因组测序的台式测序仪。它可在两种模式下开展测序实验:高产量(High Output)和中等产量(Medium Output),在单次运行中可获得20-120 Gb的数据,为您带来广泛的应用灵活性。

NextSeq550

NextSeq550在原有高通量测序平台NextSeq 500 的基础上,增加了芯片扫描功能。该系统为用户基于芯片应用转化到测序技术平台上来,搭建了新的桥梁。在临床市场,使用同一系统可以互相补充不同的应用,如细胞遗传学分析和胚胎植入前遗传病筛查等应用。因此这款为临床应用设计的平台可以开展NIPT业务,不过价格比测序仪NextSeq500高了一些。

HiSeq X Ten

HiSeq X Ten系统由10台超高通量测序仪HiSeq X组成,测序读长为2×150bp,单台仪器每次运行可产出高达1.8Tb的数据,运行时间在三天以内,即每台仪器每天产出约600Gb的数据。10台仪器同时运行时,每周至少可完成320个人类基因组测序(以30×覆盖度计算),每年完成的数量可超过18000个。

X10 芯片表面变成了孔,扩增技术模拟自然扩增,酶也发生了变化,减少了对dNTP的修饰,提高了反应速度,光学扫描速度也提高了,读长也增加。

参考

http://www.novogene.com/index.php?a=show&c=index&catid=83&id=360&m=content

http://www.macrogencn.com/_d276676746.htm

http://www.instrument.com.cn/news/20150113/151062.shtml

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