Illumina测序平台介绍
文章目录
A short introdution of Illunima sequencing machine, especially for Hiseq.
Illumina测序平台
HiSeq 2000 | HiSeq 2500 | HiSeq 3000 | HiSeq 4000 | |
---|---|---|---|---|
Output | 500-600 GB | 900-1000 GB | 630-750 GB | 1300-1500 GB |
Reads passing Filter | 1.7-2 billion | 3-3.3 billion | 2.1-2.5 billion | 4.3-5 billion |
Read Length | 2 x 100bp | 2 x 125bp | 2 x 150bp | 2 x 150bp |
Quality Scores(Q30) | >85% | >80% | >75% | >75% |
Run Time | 11 days | 6 days | 3.5 days | 3.5 days |
Human Genomes per Run | Up to 5 | Up to 8 | Up to 6 | Up to 12 |
Exomes per Run | Up to 72 | Up to 120 | Up to 90 | Up to 180 |
Transcriptomes per Run | Up to 40 | Up to 67 | Up to 50 | Up to 100 |
Hiseq 2500
Hiseq 2500是Hiseq 2000的升级版。其主要的改进点是:Hiseq 2500可以在快速、高通量两种模式之间切换。高通量模式就是原来的Hiseq2000的每张Flowcell有8个Lane的模式。
Hiseq 2500的快速模式,核心的改进是用2个Lane的Flowcell来测序,而且这种快速Flowcell的Lane比Hiseq 2000的Lane要短,数据产量也略低于高通量模式的2条Lane。
HiSeq 3000
基于成熟的HiSeq 2500系统,凭借创新的图案化流动槽技术,HiSeq 3000/4000系统带来了无可匹敌的速度和性能。双流动槽的HiSeq 4000系统提供了最高的通量和每个样品的最低价格,适合广泛的应用。而单流动槽的HiSeq 3000系统则享有同样的低价格和快速运行时间。
HiSeq 4000
HiSeq 4000系统每次运行3.5天,最多可产出1.5T数据。与HiSeq2500系统(PE125)相比,HiSeq 4000相同时间总产出是HiSeq2500的3倍。HiSeq 4000系统可平行进行单或双流动槽模式,在最短的时间内提供最大化的数据输出。
HiSeq X Ten和NextSeq 500。HiSeq X Ten定位为工厂规模的测序仪,通量超高,价格不菲;而NextSeq 500则旨在以MiSeq的大小提供HiSeq的性能。
NextSeq 500
NextSeq 500系统集高通量测序的性能和台式测序仪的简约为一体,是目前唯一一款可实现外显子组、转录组和全基因组测序的台式测序仪。它可在两种模式下开展测序实验:高产量(High Output)和中等产量(Medium Output),在单次运行中可获得20-120 Gb的数据,为您带来广泛的应用灵活性。
NextSeq550
NextSeq550在原有高通量测序平台NextSeq 500 的基础上,增加了芯片扫描功能。该系统为用户基于芯片应用转化到测序技术平台上来,搭建了新的桥梁。在临床市场,使用同一系统可以互相补充不同的应用,如细胞遗传学分析和胚胎植入前遗传病筛查等应用。因此这款为临床应用设计的平台可以开展NIPT业务,不过价格比测序仪NextSeq500高了一些。
HiSeq X Ten
HiSeq X Ten系统由10台超高通量测序仪HiSeq X组成,测序读长为2×150bp,单台仪器每次运行可产出高达1.8Tb的数据,运行时间在三天以内,即每台仪器每天产出约600Gb的数据。10台仪器同时运行时,每周至少可完成320个人类基因组测序(以30×覆盖度计算),每年完成的数量可超过18000个。
X10 芯片表面变成了孔,扩增技术模拟自然扩增,酶也发生了变化,减少了对dNTP的修饰,提高了反应速度,光学扫描速度也提高了,读长也增加。
参考
http://www.novogene.com/index.php?a=show&c=index&catid=83&id=360&m=content
http://www.macrogencn.com/_d276676746.htm
文章作者 zzx
上次更新 2016-01-31