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Illumina测序平台介绍

A short introdution of Illunima sequencing machine, especially for Hiseq.

Illumina测序平台

 

HiSeq 2000 HiSeq 2500 HiSeq 3000 HiSeq 4000
Output 500-600 GB 900-1000 GB 630-750 GB 1300-1500 GB
Reads passing Filter 1.7-2 billion 3-3.3 billion 2.1-2.5 billion 4.3-5 billion
Read Length 2 x 100bp 2 x 125bp 2 x 150bp 2 x 150bp
Quality Scores(Q30) >85% >80% >75% >75%
Run Time 11 days 6 days 3.5 days 3.5 days
Human Genomes per Run Up to 5 Up to 8 Up to 6 Up to 12
Exomes per Run Up to 72 Up to 120 Up to 90 Up to 180
Transcriptomes per Run Up to 40 Up to 67 Up to 50 Up to 100

hiseq-x-ten Illumina测序平台

Hiseq 2500

Hiseq 2500是Hiseq 2000的升级版。其主要的改进点是:Hiseq 2500可以在快速、高通量两种模式之间切换。高通量模式就是原来的Hiseq2000的每张Flowcell有8个Lane的模式。 继续阅读