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本站纯属个人博客,关注精准医疗和测序大数据。
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- 本人生于齐鲁大地,在SDAU大一的时候,由计算机老师引入生物信息的大门,ZJU研究生毕业,杭州工作4年,现在CityU HK。现在是信息爆炸的时代,我深信,海量的生物数据之中,有着无数的奥秘和价值。我认为社会的进步基于前人的积累,正如站在巨人的肩膀上,术业有专攻,会开车不一定要学会造车,我在这里分享相关技术,是为了总结自己学习的知识,也是为了方便大家。
- 本人对自己的要求:1,很多知识自己不一定会,但可以先了解大概,这样在用到的时候可以想到;2,要善于利用工具,提高效率;3,要多学多看多请教;4,要善于分享知识和团队合作。
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看了你的博文,很不错,我是做植物关联分析的,最近在学习VCF相关的一些软件,有些不明白的地方,可以请教下吗
当然可以,如果我能帮到,一定会告诉你,大家一起进步。
hi!想请教一下,可以吗?
请讲
您好,跑GATK ValidateSamFile报错,能给我您的邮箱么?想求助下大佬~
您好,请教问题:MuSic2的roi文件如何制作?
hi, 您是不是转到医口方向了,我也是从事肿瘤临检生信这块的;
想咨询一下 CoNVaDING和DECoN简评–基于Panel测序的外显子拷贝数变异分析 中用的样品数据应该是标准品吧? 我也想测试一下自己的小panel 数据 分析cnv的流程, 从哪里可以下载到呢?
可以加您微信吗?
标准品是公司买的,测序和分析都是在内部完成的
您好,请教您一个问题,就是Dapars2软件分析APA的时候,第三步 Generate mapped reads files for all Samples,这一步是怎么实现的?谢谢!
我用的是QC之后的reads数,在linux下用zcat fastq.gz | wc -l | wc -l | awk ‘{print $1/4}’
你也可以从STAR的输出中,算比对上的reads